Pemain timnas Belgia itu terekam meninggalkan Johan Cruyff Arena dengan bantuan tongkat penyangga dengan kaki kanannya dibalut pelindung.
Vertonghen harus bermain dengan memakai masker saat Tottenham menang 3-2 pada leg kedua, guna melindungi hidungnya setelah bertubrukkan dengan rekan satu timnya Toby Alderweireld ketika Spurs kalah 0-1 pada leg pertama di London.
Pemain berusia 32 tahun itu bermain penuh 90 menit di Amsterdam untuk mengantarkan tim London Utara itu merebut satu tempat final melawan Liverpool di Madrid pada 1 Juni.
Meskipuun Spurs belum berkomentar apa-apa soal kondisi Vertonghen, cedera itu membuatnya diragukan tampil pada pertandingan terakhir Liga Premier melawan Everton, Minggu pekan ini.
Tim asuhan Mauricio Pochettino saat ini menduduki peringkat keempat klasemen di atas Arsenal.
Spurs dipastikan masuk kualifikasi Liga Champions karena selisih gol yang lebar sekali dari Arsenal.
Baca juga: Liverpool menginspirasi Tottenham